参考答案

共同点：二者都享有自治权，都是中央人民政府管辖下的地方行政区域。
区别：①设立的地区不同：特别行政区是在港、澳、台地区设立的，而民族自治区是在少数民族聚居的地区设立的，实行区域自治，设立自治机关，行使自治权。
②自治程度不同：民族自治区有“一定的自治权”，在国家计划指导下，可根据本地方特点和需要，自主管理经济、财政、教育、科学、文化等事业。而特别行政区享有“高度的自治权”。除外交和国防事务外，享有行政管理权、立法权、独立的司法权和终审权。经国务院授权，还可以在经济文化领域方面处理某些涉外事务。
③社会制度不同：前者实行原有的资本主义制度，而后者则坚持社会主义制度。
④设立的目的不同：前者是为了解决历史遗留问题，实现祖国和平统一而设立的。后者是为了解决民族问题，处理好民族关系，实现少数民族当家作主，管理本民族地区事务的愿望而设立的。