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甲公司诉乙公司合同纠纷案，南山市S县法院进行了审理并作出驳回甲公司诉讼请求的判决，甲公司未提出上诉。判决生效后，甲公司因收集到新的证据申请再审。下列哪些选项是正确的？

A．甲公司应当向S县法院申请再审

B．甲公司应当向南山市中级法院申请再审

C．法院应当适用一审程序再审本案

D．法院应当适用二审程序再审本案

请帮忙给出正确答案和分析，谢谢！